定向进化项目工作台
草稿待完善
S 122,400 星币

定向进化智能助理

0%
先补充蛋白序列和优化目标。
对话上下文 本地规则模式 · 1 条
Directed Evolution Project

JustEvo测试项目-0618

-- 本轮预计扣费
-- 本轮实际扣费
-- 累计扣费
4 已完成轮次
1 输入数据
2 评估扣费
3 定向进化
4 实验方案
5 结果回填
第 1 轮次草稿输入参数 右侧表单会作为下一轮定向进化计算的输入。

项目基础信息

Step 1

冷启动初始化选项

ProSST warm-up
WT FASTA(算力必需)与 PDB 结构(可选)
PDB 只在勾选"先做冷启动初始化"、选择 PT-DiT 单模型或完整 MoE 时才用得上;没传的话 kit 会自动用 ESM2/ESMFold2 预测生成,效果不如真实结构。填了的话残基编号需与 FASTA 一致。

拖拽选择突变范围;可叠加多个范围,重复拖过已选范围可移除。

0 aa 序列长度
全序列位点进入突变 library。

优化目标与实验约束

Step 2

实验数据定义

Readout schema
单目标优化需要 1 个实验数据定义;多目标联合优化需要至少 2 个。
当前为单目标优化:系统围绕主实验数据定义生成推荐;突变可开发性评估只在结果里给出各候选的性质百分位。

突变规则表

Library constraints
突变深度

突变可开发性评估

Step 4

数据与计算配置

Step 3

冷启动设置

Cold-start engines

突变实验数据库

第 1 轮可选择 cold-start,若已有突变数据请填写。

下载模板会按当前实验数据定义生成 readout 列。每一轮都要测同批 WT 对照并填写实测值,用于批次标定和归一化;突变体使用 S65T/F64L 格式。

variant_id 突变 轮次 实验 readout 质控备注
任务状态 尚未提交

算法引擎进化

未连接
只读结果区 确认扣费后自动运行 本站服务端
计算轮次 --
模型 --
训练数据 --
最佳 fitness --
Rank 突变 实测 fitness 模型打分 可开发性
提交任务后写入当前账号项目。

候选突变结果表单

等待计算
Rank 候选 实测收益 可开发性 模型打分 建议
提交任务后生成候选结果。

打分区分度

model score

打分 × 可开发性

kit 数据

可开发性指标

按 rank
Wet-lab plan

等待生成实验方案

计算完成后,这里会生成候选构建、实验执行、质控与扣费记录;实验返回值在后续闭环表单中填写。

扣费记录 -- 尚未扣费

候选优先级

尚无结论。

本轮湿实验设计

提交并完成计算后生成。

风险与质控

  • 等待输入数据和项目评估。

可下载表单

Wet-lab feedback

结果回填

本表同步当前轮次的突变实验数据库记录;先填写本轮 WT 同批对照,再按实验数据定义填写候选实测值、质控和批次信息,写回后用于下一轮已有数据驱动。

闭环状态 待填写 写回后用于下一轮已有数据驱动

湿实验结果表单

readout feedback
variant_id 候选突变 轮次 实测 readout 批次 质控状态 备注
计算完成后,根据本轮候选自动生成湿实验结果表。